Il Sistema Qualità di Agrisana garantisce la conformità con le attuali Norme di Buona Fabbricazione (cGMP) e le linee guida “Hazard Analysis and Critical Control Points” (HACCP) per gestire derivati naturali di grado farmaceutico e alimentare.

Esso prevede l'interazione tra la Direzione di Stabilimento, il Controllo Qualità e l’Assicurazione Qualità sotto il coordinamento della Persona Qualificata, in accordo al Decreto Legge 219/2006. Il sito è periodicamente ispezionato dall’Agenzia Italiana del Farmaco (AIFA) e dall’Azienda Sanitaria Locale (ASL); riceve inoltre regolarmente Audit GMP e di Qualità da clienti europei e asiatici.